สิบหกปีที่ผ่านมานินจาสวมหน้ากากลึกลับปลดปล่อยสัตว์ที่ทรงพลังที่รู้จักในนามจิ้งจอกจิ้งจอกเก้าหางในหมู่บ้านใบไม้แห่งความลับโคโนฮะฆ่าผู้คนจำนวนมาก ในการตอบสนอง Hokage Minato Namikaze คนที่สี่และภรรยาของเขา Kushina Uzumaki คุกปีศาจของ Fox Fox หรือJinchūrikiจัดการปิดผนึกสิ่งมีชีวิตใน Naruto Uzumaki ลูกชายคนแรกของพวกเขา เมื่อสัตว์ผนึกถูกปิดผนึกสิ่งต่าง ๆ ก็ดำเนินต่อไปตามปกติ อย่างไรก็ตามในยุคปัจจุบันความสงบสุขสิ้นสุดลงเมื่อกลุ่มนินจาที่เรียกว่า Akatsuki โจมตี Konoha ภายใต้การแนะนำของ Tobi ชายลึกลับสวมหน้ากากหลังอาละวาดของ Fox เมื่อหลายปีก่อนที่ตั้งใจจะดำเนินแผนการของเขาเพื่อปกครองโลก